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HomeMy WebLinkAboutItem No. 11 PPP 02-09-2022 Administration Committee - COVID Sewer Surveillance Update v22/9/2022 1 Update on OC San’s COVID‐19  Sewage Surveillance Efforts Samuel Choi, Lab  and Ocean  Monitoring  Manager, ESD Prepared for  Administration Committee 2/9/2022 •Introduction to sewage surveillance •OC San, SWRCB/CDPH, and CDC efforts •Next steps •Acknowledgement Presentation 1 2 2/9/2022 2 What is sewage surveillance (WBE)? •Measure microbiological markers in wastewater •Community‐level infection •Augment clinical surveillance •Inform on public health interventions How is it used during COVID‐19?  •SARS‐CoV‐2 markers shed in feces (symptomatic/asymptomatic) •Early and unbiased indicator of changes in community infection •Variant detection Sewage Surveillance Early Days –A lot of Unknowns 9 days later, in a follow-up article 4 3 4 2/9/2022 3 Wait or Innovate?  Lessons from prior wastewater surveillance efforts Obtain expert advice Establish current and future use cases Sustainable field and laboratory resources Criteria for collaboration OC San Efforts •Started with 4 partners and narrowed down to lab that met our needs  •Current partnership with CDPH and SWRCB to support CDC NWSS 5 6 2/9/2022 4 California and National Efforts •California NWSS •Part of CDC’s NWSS •Began 12/2020 with 5 largest  wastewater agencies •Currently includes 22 agencies •Monitor sewage for SARS‐CoV‐2  marker and variants  •Data transmitted to CDC NWSS portal OC San Sewage Surveillance 0 1000 2000 3000 4000 5000 6000 7000 8000 9000 0 15 30 45 60 4/ 1 3 / 2 0 4/ 2 7 / 2 0 5/ 1 1 / 2 0 5/ 2 5 / 2 0 6/8 / 2 0 6/ 2 2 / 2 0 7/6 / 2 0 7/ 2 0 / 2 0 8/3 / 2 0 8/ 1 7 / 2 0 8/ 3 1 / 2 0 9/ 1 4 / 2 0 9/ 2 8 / 2 0 10 / 1 2 / 2 0 10 / 2 6 / 2 0 11 / 9 / 2 0 11 / 2 3 / 2 0 12 / 7 / 2 0 12 / 2 1 / 2 0 1/4 / 2 1 1/ 1 8 / 2 1 2/1 / 2 1 2/ 1 5 / 2 1 3/1 / 2 1 3/ 1 5 / 2 1 3/ 2 9 / 2 1 4/ 1 2 / 2 1 4/ 2 6 / 2 1 5/ 1 0 / 2 1 5/ 2 4 / 2 1 6/7 / 2 1 6/ 2 1 / 2 1 7/5 / 2 1 7/ 1 9 / 2 1 8/2 / 2 1 8/ 1 6 / 2 1 8/ 3 0 / 2 1 9/ 1 3 / 2 1 9/ 2 7 / 2 1 10 / 1 1 / 2 1 10 / 2 5 / 2 1 11 / 8 / 2 1 11 / 2 2 / 2 1 12 / 6 / 2 1 12 / 2 0 / 2 1 1/3 / 2 2 1/ 1 7 / 2 2 OC  Sa n  Se r v i c e  Ar e a  ‐ Ne w  Ca s e s  (7 ‐Da y  Av e r a g e ) Co r o n a v i r u s  Ma r k e r  Co n c e n t r a t i o n (m i l l i o n s  of  SA R S ‐Co V ‐2 RN A  ge n e  co p i e s  pe r  li t e r ) Coronavirus in Sewage at OC San Plant 1 (Data through 1/24/2022) New Cases (7‐day average) ‐ OC San Service Area Coronavirus Concentration (DPR‐2) Coronavirus Concentration (SCCWRP) Coronavirus Concentration (ZYMO) Notes: For recent dates, new case numbers are preliminary. Non‐detect results are not shown on graph. 7 8 2/9/2022 5 OC San Sewage Surveillance 0 1000 2000 3000 4000 5000 6000 7000 8000 9000 0 15 30 45 60 OC  Sa n  Se r v i c e  Ar e a   ‐ Ne w  Ca s e s  (7 ‐Da y  Av e r a g e ) Co r o n a v i r u s  Ma r k e r  Co n c e n t r a t i o n (m i l l i o n s  of SA R S ‐Co V ‐2 RN A  ge n e  co p i e s  pe r  li t e r ) Coronavirus in Sewage at OC San Plant 1 (Data through 1/24/2022) New Cases (7‐day average) ‐ OC San Service Area Coronavirus Concentration (ZYMO) Notes: For recent dates, new case numbers are preliminary. Non‐detect results are not shown on graph. Past 2 months  •Last 10 days: decreasing •Levels lower vs. 2 weeks ago  •Levels lower vs. 4 weeks ago  4 we e k s  ag o 2 we e k s  ag o 10‐Day  Trend Looking Ahead • Continue to partner with CDPH and SWRCB to support CDC NWSS • Test sewage 3x/week through December 2022 • Continue surveillance and add variant monitoring OC San CDPH /  SWRCB CDC  NWSS 9 10 2/9/2022 6 This Photoby Unknown Author is licensed  under CC BY‐NC Statewide Recognition for OC San CDC Public Dashboard https://covid.cdc.gov/covid‐data‐tracker 11 12 2/9/2022 7 •Margil Jimenez –Scientist •Jennifer Cabral –PAO Manager •Management  •Partners Acknowledgements Questions ? Samuel Choi schoi@ocsan.gov 13 14